1. เติมน้ำเปล่าใส่หม้อ ต้มด้วยไฟแรงปานกลางจนน้ำเดือดแล้วใส่ผงปรุงรสกับเกลือป่นลงไป รอจนเดือดอีกครั้งใส่หอมแดงทุบ และเครื่องต้มยำลงไป
2. เมื่อน้ำเดือดจัด ๆ แล้วใส่เนื้อปลาช่อนลงไป ไม่ต้องคนอะไรทั้งสิ้นปิดฝารอเดือดอีกครั้ง จากนั้นใส่มะเขือเทศลงไป ปรุงรสด้วยน้ำปลาปิดฝารอเดือดแล้วจึงปิดไฟ
3. เอาใส่น้ำมะนาวลงในชาม ตามด้วยพริกขี้หนูโขลกเผ็ดมากน้อยตามใจชอบ จากนั้นตักต้มยำใส่ลงไป เสิร์ฟได้